Munkkivuoren apteekki on perustettu vuonna 1959 tuolloin valmistuneeseen Suomen ensimmäiseen ostoskeskukseen Munkkivuoreen.
Nykyisessä paikassaan apteekki on sijainnut vuodesta 1984. Tällöin apteekki muutti vastavalmistuneeseen Lääkärikeskus Dextran taloon.
Apteekin myymälätilat on uusittu marraskuussa 2023. Edellinen remontti tehtiin 2015.